Plateau Transcriptomique Quantitative IFR150-BMT

  
 
 
      Bât L4, 2ème étage, pièce 245,
BP84255 31432 TOULOUSE Cedex 4 		Tel 05-61-32-56-38
Fax: 05-61-32-56-23
     

Le plateau de Transcriptomique Quantitative, labellisé IBISA, constitue une antenne de la plateforme BIOPUCE
du Genopole Toulouse Midi Pyrénées (Genotoul). Il est sous la responsabilité de Jean-José Maoret. Il est localisé
dans le bâtiment L4 de l'Institut de Médecine Moléculaire de Rangueil (I2MR Inserm UPS U858).
L'ensemble des matériels est accessible après inscription dans les formulaires de réservation et acceptation de la charte.
Seules les personnes ayant suivi une formation à l’utilisation de ce matériel sont autorisées à l’utiliser.
Pour les demandes de nouveaux projets un dépôt de protocole doit être fait. 
[Charte] [Tarifs] [Fiche protocole] [ ]

Principe de la PCR en temps réel

La PCR quantitative (ou PCR en temps réel Q-PCR) permet de quantifier avec sensibilité et précision le niveau d’expression des gènes pour l’étude du transcriptome. La technique consiste à mesurer par fluorescence la cinétique d’amplification spécifique d’une séquence d’ADN cible ou d’ADNc obtenu à partir d’ARNs purifiés.


ABI 7900

Sur cette machine équipée d'un système de détection laser, le bloc PCR est démontable et interchangeable. La machine est équipée d'un bloc 96 puits pour un profil de thermocyclage classique, d'un bloc 96 puits pour un thermocyclage "FAST" et d'un bloc pour "microfluidic card (TLA)"
Ses possibilités de paramétrage permettent d’utiliser différents types de protocoles (absolute quantification, CT) Possibilité de regrouper au sein d'une "étude" jusqu'à 10 fichiers de run pour en faire l'analyse globale.
Calcul de la ligne de base et du CT automatique ou manuel. Calcul de CT et Rq automatiques.
Cet appareil est équipé d’un robot passeur de plaques gérant jusqu’à 80 plaques 96 puits ou TLDA.

[Réserver cette machine] [Documents et logiciels QPCR] [Description de cette machine]


Stepone +
 La mesure de la fluorescence de cet appareil se fait à travers un large spectre de longueurs d'ondes dans les puits au cours de la réaction PCR. Donc, possibilité de faire du multiplexage. Possibilité de travailler en tubes ou en plaques 96 puits. Calcul de la ligne de base et du CT automatique ou manuel. Calcul des CT et Rq automatiques.
Ses possibilités de paramétrage permettent d’utiliser différents types de protocoles (absolute quantification, CT, dissociation, etc...)
Equipé d'un bloc de thermocylage "FAST" cet appareil permet de travailler avec toutes les chimies commercialisées.

[Réserver la machine N°1]
[Réserver la machine N°2]
[Documents et logiciels QPCR]

ABI 7500 Fast
Equipé d'un bloc de thermocylage "FAST" cet appareil permet de travailler avec toutes les chimies commercialisées. Son logiciel d’analyse (2.0.1) permet de travailler sur des groupes d’individus, d’avoir un calcul de la ligne de base et du CT automatique ou manuel et d’avoir un calcul des CT et Rq automatiques

[Réserver cette machine] [Documents et logiciels QPCR]

HRM
 La technique HRM permet de faire de la recherche de mutations, du génotypage ou de calculer le taux de methylation de l’ADN génomique par étude des courbes de fusion réalisées après PCR. Cette PCR peut être faite en utilisant différents fluorochromes (SYTO 9, LC GreenI, LC Green Plus ou EVA Green pour l’ABI 7500 et SYTO 9 ou EVA Green pour l’ABI 7900). Le logiciel HRM V2 est capable de traiter ces courbes de fusion pour différencier les bases en présence dans la matrice.

[Télédécharger le logiciel]

Experion
 Basé sur un système d'électrophorèse capillaire couplé à un réseau de microfluidique, cet appareil permet l'analyse qualitative et quantitative de microéchantillons d'acide nucléiques et de protéines.
[Réserver cette machine] [Description de cette machine et logiciels]